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Bluues Server: electrostatic properties of wild-type and mutated protein structures. 1-gen-2012 Walsh, I; Minervini, G; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro; Tosatto, Sce; Fogolari, Federico
Fast structure similarity searches among protein models: efficient clustering of protein fragments. 1-gen-2012 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Viglino, P; Esposito, Gennaro
Bluues: a program for the analysis of the electrostatic properties of proteins based on generalized Born radii 1-gen-2012 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Yarra, V; Jalaru, A; Viglino, P; Esposito, Gennaro
Rapid Protein Oligomer Formation of Human Muscle Acylphosphatase Induced by Heparan Sulfate 1-gen-2012 Motamedi Shad, N.; Garfagnini, T.; Penco, A.; Relini, A.; Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro; Bemporad, F.; Chiti, F.
Absolute quantification of choline-related biomarkers in breast cancer biopsies by liquid chromatography electrospray ionization mass spectrometry 1-gen-2013 Mimmi, Maria Chiara; Finato, Nicoletta; G., Pizzolato; Beltrami, Carlo Alberto; Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
Carnosine inhibits Aβ42 aggregation by perturbing the H-bond network in and around the centralhydrophobic cluster 1-gen-2013 Attanasio, F.; Convertino, M.; Magno, A.; Caflisch, A.; Corazza, A.; Haridas, H.; Esposito, G.; Cataldo, S.; Pignataro, B.; Milardi, D.; Rizzarelli, E.
Reduction of conformational mobility and aggregation in W60G β2-microglobulin: assessment by 15N NMR relaxation 1-gen-2013 GUMRAL GOKKAYA, Devrim; Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Viglino, Paolo; S., Giorgetti; M., Stoppini; V., Bellotti; Esposito, Gennaro
A differential equation for the Generalized Born radii 1-gen-2013 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
Structure, folding dynamics, and amyloidogenesis of D76N β2-microglobulin: roles of shear flow, hydrophobic surfaces, and α-crystallin 1-gen-2013 P. P., Mangione; Esposito, Gennaro; A., Relini; S., Raimondi; R., Porcari; S., Giorgetti; Corazza, Alessandra; Fogolari, Federico; A., Penco; Y., Goto; Y. H., Lee; H., Yagi; C., Cecconi; M. M., Naqvi; J. D., Gillmore; P. N., Hawkins; F., Chiti; R., Rolandi; G. W., Taylor; M. B., Pepys; M., Stoppini; V., Bellotti
Protein Aggregation Measurement through Electrical Impedance Spectroscopy 1-gen-2013 Affanni, Antonio; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro; Fogolari, Federico; Polano, M.
Oligomeric States along the Folding Pathways of β2-Microglobulin: Kinetics, Thermodynamics, and Structure 1-gen-2013 Rennella, E.; Cutuil, T.; Schanda, P.; Ayala, I.; Gabel, F.; Forge, V; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro; Brutscher, B.
Monitoring the interaction between β2-microglobulin and the molecular chaperone αB-crystallin by NMR and mass spectrometry: αB-crystallin dissociates β2-microglobulin oligomers 1-gen-2013 Esposito, Gennaro; M., Garvey; Alverdi, Vera; Pettirossi, Fabio; Corazza, Alessandra; Fogolari, Federico; Polano, Maurizio; P. P., Mangione; S., Giorgetti; M., Stoppini; A., Rekas; V., Bellotti; A. J., Heck; J. A., Carver
Generalized Born forces: surface integral formulation 1-gen-2013 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
The Accuracy of Generalized Born Forces 1-gen-2015 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
Distance-Based Configurational Entropy of Proteins from Molecular Dynamics Simulations 1-gen-2015 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Fortuna, Sara; Soler, Miguel Angel; Vanschouwen, Bryan; Brancolini, Giorgia; Corni, Stefano; Melacini, Giuseppe; Esposito, Gennaro
Accuracy assessment of the linear Poisson-Boltzmann equation and reparametrization of the OBC generalized Born model for nucleic acids and nucleic acid-protein complexes 1-gen-2015 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
Probing the influence of citrate-capped gold nanoparticles on an amyloidogenic protein 1-gen-2015 Brancolini, Giorgia; Corazza, Alessandra; Vuano, Marco; Fogolari, Federico; Mimmi, Maria Chiara; Bellotti, Vittorio; Stoppini, Monica; Corni, Stefano; Esposito, Gennaro
Rational design of mutations that change the aggregation rate of a protein while maintaining its native structure and stability 1-gen-2016 Camilloni, Carlo; Sala, Benedetta Maria; Sormanni, Pietro; Porcari, Riccardo; Corazza, Alessandra; De Rosa, Matteo; Zanini, Stefano; Barbigli, Alberto; Esposito, Gennaro; Bolognesi, Martino; Bellotti, Vittorio; Vendruscolo, Michele; Ricagno, Stefano
Accurate estimation of the entropy of rotation-translation probability distributions 1-gen-2016 Fogolari, Federico; DONGMO FOUMTHUIM, Cedrix Jurgal; Fortuna, Sara; Soler, Miguel A; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
Citrate-stabilized Gold Nanoparticles hinder fibrillogenesis of a pathologic variant of β2-microglobulin 1-gen-2017 Cantarutti, Cristina; Raymond, Sara; Brancolini, Giorgia; Corazza, Alessandra; Giorgetti, Sofia; Ballico, Maurizio; Zanini, Stefano; Palmisano, Giovanni; Bertoncin, Paolo; Marchese, Loredana; Mangione, P. Patrizia; Bellotti, Vittorio; Corni, Stefano; Fogolari, Federico; Esposito, Gennaro
Short-Chain Alkanethiol Coating for Small-Size Gold Nanoparticles Supporting Protein Stability 1-gen-2017 Cantarutti, Cristina; Bertoncin, Paolo; Corazza, Alessandra; Giorgetti, Sofia; Mangione, P.; Bellotti, Vittorio; Fogolari, Federico; Esposito, Gennaro
Molecular dynamics simulations of β2-microglobulin interaction with hydrophobic surfaces 1-gen-2017 Dongmo Foumthuim, Cedrix J.; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro; Fogolari, Federico
Automation of peak-tracking analysis of stepwise perturbed NMR spectra 1-gen-2017 Banelli, Tommaso; Vuano, Marco; Fogolari, Federico; Fusiello, Andrea; Esposito, Gennaro; Corazza, Alessandra
Inhibition of the mechano-enzymatic amyloidogenesis of transthyretin: role of ligand affinity, binding cooperativity and occupancy of the inner channel 1-gen-2017 Verona, Guglielmo; Mangione, P. Patrizia; Raimondi, Sara; Giorgetti, Sofia; Faravelli, Giulia; Porcari, Riccardo; Corazza, Alessandra; Gillmore, Julian D; Hawkins, Philip N; Pepys, Mark B; Taylor, Graham W; Bellotti, Vittorio
1H, 13C and 15N backbone resonance assignments of the β-lactamase BlaP from Bacillus licheniformis 749/C and two mutational variants 1-gen-2017 Thorn, David; Kay, Jennifer; Rhazi, Noureddine; Dumoulin, Mireille; Corazza, Alessandra; Damblon, Christian
Computational design of cyclic peptides for the customized oriented immobilization of globular proteins 1-gen-2017 SOLER BASTIDA, Miguel Angel; Rodriguez, Alex; Russo, Anna; Adedeji, Abimbola Feyisara; Dongmo Foumthuim, Cedrix J.; Cantarutti, Cristina; Ambrosetti, Elena; Casalis, Loredana; Corazza, Alessandra; Scoles, Giacinto; Marasco, Daniela; Laio, Alessandro; Fortuna, Sara
A specific nanobody prevents amyloidogenesis of D76N β2-microglobulin in vitro and modifies its tissue distribution in vivo 1-gen-2017 Sara, Raimondi; Riccardo, Porcari; Patrizia Mangione, P.; Guglielmo, Verona; Julien, Marcoux; Sofia, Giorgetti; Graham, W. Taylor; Stephan, Ellmerich; Ballico, Maurizio; Stefano, Zanini; Els, Pardon; Raya, Al Shawi; Paul Simons, J.; Corazza, Alessandra; Fogolari, Federico; Manuela, Leri; Massimo, Stefani; Monica, Bucciantini; Julian, D. Gillmore; Philip, N. Hawkins; Maurizia, Valli; Monica, Stoppini; Carol, V. Robinson; Jan, Steyaert; Esposito, Gennaro; Vittorio, Bellotti
Plasminogen activation triggers transthyretin amyloidogenesis in vitro 1-gen-2018 Mangione, P. P.; Verona, G.; Corazza, A.; Marcoux, J.; Canetti, D.; Giorgetti, S.; Raimondi, S.; Stoppini, M.; Esposito, M.; Relini, A.; Canale, C.; Valli, M.; Marchese, L.; Faravelli, G.; Obici, L.; Hawkins, P. N.; Taylor, G. W.; Gillmore, J. D.; Pepys, M. B.; Bellotti, V.
Free Energy, Enthalpy and Entropy from Implicit Solvent End-Point Simulations 1-gen-2018 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
PDB2ENTROPY and PDB2TRENT: Conformational and Translational-Rotational Entropy from Molecular Ensembles 1-gen-2018 Fogolari, Federico; Maloku, Ornela; Dongmo Foumthuim, Cedrix Jurgal; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
Citrate stabilized gold nanoparticles interfere with amyloid fibril formation: D76N and Δn6 β2-microglobulin variants 1-gen-2018 Brancolini, Giorgia; Maschio, Maria Celeste; Cantarutti, Cristina; Corazza, Alessandra; Fogolari, Federico; Bellotti, Vittorio; Corni, Stefano; Esposito, Gennaro
Dynamics and Thermodynamics of Transthyretin Association from Molecular Dynamics Simulations 1-gen-2018 Dongmo Foumthuim, Cedrix J.; Corazza, Alessandra; Berni, Rodolfo; Esposito, Gennaro; Fogolari, Federico
Interference of citrate-stabilized gold nanoparticles with β2-microglobulin oligomeric association 1-gen-2018 Cantarutti, Cristina; Raj, Gijo; Fogolari, Federico; Giorgetti, Sofia; Corazza, Alessandra; Bellotti, Vittorio; Naumov, Panče; Esposito, Gennaro
Binding of Monovalent and Bivalent Ligands by Transthyretin Causes Different Short- and Long-Distance Conformational Changes 1-gen-2019 Corazza, A.; Verona, G.; Waudby, C. A.; Mangione, P. P.; Bingham, R.; Uings, I.; Canetti, D.; Nocerino, P.; Taylor, G. W.; Pepys, M. B.; Christodoulou, J.; Bellotti, V.
Comparative study of the stabilities of synthetic in vitro and natural ex vivo transthyretin amyloid fibrils 1-gen-2020 Raimondi, S.; Mangione, P. P.; Verona, G.; Canetti, D.; Nocerino, P.; Marchese, L.; Piccarducci, R.; Mondani, V.; Faravelli, G.; Taylor, G. W.; Gillmore, J. D.; Corazza, A.; Pepys, M. B.; Giorgetti, S.; Bellotti, V.
Clinical ApoA-IV amyloid is associated with fibrillogenic signal sequence 1-gen-2021 Canetti, D.; Nocerino, P.; Rendell, N. B.; Botcher, N.; Gilbertson, J. A.; Blanco, A.; Rowczenio, D.; Morelli, A.; Mangione, P. P.; Corazza, A.; Verona, G.; Giorgetti, S.; Marchese, L.; Westermark, P.; Hawkins, P. N.; Gillmore, J. D.; Bellotti, V.; Taylor, G. W.
Insights on peptide topology in the computational design of protein ligands: The example of lysozyme binding peptides 1-gen-2021 Cantarutti, C.; Vargas, M. C.; Dongmo Foumthuim, C. J.; Dumoulin, M.; La Manna, S.; Marasco, D.; Santambrogio, C.; Grandori, R.; Scoles, G.; Soler, M. A.; Corazza, A.; Fortuna, S.
Conversion of the Native N-Terminal Domain of TDP-43 into a Monomeric Alternative Fold with Lower Aggregation Propensity 1-gen-2022 Moretti, M.; Marzi, I.; Cantarutti, C.; Vega, M. V.; Mandaliti, W.; Mimmi, M. C.; Bemporad, F.; Corazza, A.; Chiti, F.
Calcium Binds to Transthyretin with Low Affinity 1-gen-2022 Cantarutti, C; Mimmi, Mc; Verona, G; Mandaliti, W; Taylor, Gw; Mangione, Pp; Giorgetti, S; Bellotti, V; Corazza, A
Amyloid Formation by Globular Proteins: The Need to Narrow the Gap Between in Vitro and in Vivo Mechanisms 1-gen-2022 Faravelli, G.; Mondani, V.; Mangione, P. P.; Raimondi, S.; Marchese, L.; Lavatelli, F.; Stoppini, M.; Corazza, A.; Canetti, D.; Verona, G.; Obici, L.; Taylor, G. W.; Gillmore, J. D.; Giorgetti, S.; Bellotti, V.
Cyclophilin D in Mitochondrial Dysfunction: A Key Player in Neurodegeneration? 1-gen-2023 Coluccino, G.; Muraca, V. P.; Corazza, A.; Lippe, G.
Degradation versus fibrillogenesis, two alternative pathways modulated by seeds and glycosaminoglycans 1-gen-2024 Verona, G.; Raimondi, S.; Canetti, D.; Mangione, P. P.; Marchese, L.; Corazza, A.; Lavatelli, F.; Gillmore, J. D.; Taylor, G. W.; Bellotti, V.; Giorgetti, S.
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