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SOLER BASTIDA, Miguel Angel

SOLER BASTIDA, Miguel Angel  

DMIF - DIPARTIMENTO DI SCIENZE MATEMATICHE, INFORMATICHE E FISICHE  

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Titolo Data di pubblicazione Autore(i) File
A consensus protocol for the In silico optimisation of antibody fragments 1-gen-2019 Soler, M. A.; Medagli, B.; Semrau, M. S.; Storici, P.; Bajc, G.; De Marco, A.; Laio, A.; Fortuna, S.
A homozygous MED11 C-terminal variant causes a lethal neurodegenerative disease 1-gen-2022 Calì, Elisa; Lin, Sheng-Jia; Rocca, Clarissa; Sahin, Yavuz; Al Shamsi, Aisha; El Chehadeh, Salima; Chaabouni, Myriam; Mankad, Kshitij; Galanaki, Evangelia; Efthymiou, Stephanie; Sudhakar, Sniya; Athanasiou-Fragkouli, Alkyoni; Çelik, Tamer; Narlı, Nejat; Bianca, Sebastiano; Murphy, David; De Carvalho Moreira, Francisco Martins; Accogli, Andrea; Petree, Cassidy; Huang, Kevin; Monastiri, Kamel; Edizadeh, Masoud; Nardello, Rosaria; Ognibene, Marzia; De Marco, Patrizia; Ruggieri, Martino; Zara, Federico; Striano, Pasquale; Şahin, Yavuz; Al-Gazali, Lihadh; Abi Warde, Marie Therese; Gerard, Benedicte; Zifarelli, Giovanni; Beetz, Christian; Fortuna, Sara; Soler, Miguel; Valente, Enza Maria; Varshney, Gaurav; Maroofian, Reza; Salpietro, Vincenzo; Houlden, Henry
A method for analyzing the vibrational energy flow in biomolecules in solution 1-gen-2011 Soler, M. A.; Bastida, A.; Farag, M. H.; Zuniga, J.; Requena, A.
A PAK1 Mutational Hotspot Within the Regulatory CRIPaK Domain is Associated With Severe Neurodevelopmental Disorders in Children 1-gen-2023 Scorrano, G.; D'Onofrio, G.; Accogli, A.; Severino, M.; Buchert, R.; Kotzaeridou, U.; Iapadre, G.; Farello, G.; Iacomino, M.; Dono, F.; Di Francesco, L.; Fiorile, M. F.; La Bella, S.; Corsello, A.; Cali, E.; Di Rosa, G.; Gitto, E.; Verrotti, A.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Chiarelli, F.; Oehl-Jaschkowitz, B.; Haack, T. B.; Zara, F.; Striano, P.; Salpietro, V.
Accurate estimation of the entropy of rotation-translation probability distributions 1-gen-2016 Fogolari, Federico; DONGMO FOUMTHUIM, Cedrix Jurgal; Fortuna, Sara; Soler, Miguel A; Corazza, Alessandra; Esposito, Gennaro
AMPA receptor GluA2 subunit defects are a cause of neurodevelopmental disorders 1-gen-2019 Salpietro, V.; Dixon, C. L.; Guo, H.; Bello, O. D.; Vandrovcova, J.; Efthymiou, S.; Maroofian, R.; Heimer, G.; Burglen, L.; Valence, S.; Torti, E.; Hacke, M.; Rankin, J.; Tariq, H.; Colin, E.; Procaccio, V.; Striano, P.; Mankad, K.; Lieb, A.; Chen, S.; Pisani, L.; Bettencourt, C.; Mannikko, R.; Manole, A.; Brusco, A.; Grosso, E.; Ferrero, G. B.; Armstrong-Moron, J.; Gueden, S.; Bar-Yosef, O.; Tzadok, M.; Monaghan, K. G.; Santiago-Sim, T.; Person, R. E.; Cho, M. T.; Willaert, R.; Yoo, Y.; Chae, J. -H.; Quan, Y.; Wu, H.; Wang, T.; Bernier, R. A.; Xia, K.; Blesson, A.; Jain, M.; Motazacker, M. M.; Jaeger, B.; Schneider, A. L.; Boysen, K.; Muir, A. M.; Myers, C. T.; Gavrilova, R. H.; Gunderson, L.; Schultz-Rogers, L.; Klee, E. W.; Dyment, D.; Osmond, M.; Parellada, M.; Llorente, C.; Gonzalez-Penas, J.; Carracedo, A.; Van Haeringen, A.; Ruivenkamp, C.; Nava, C.; Heron, D.; Nardello, R.; Iacomino, M.; Minetti, C.; Skabar, A.; Fabretto, A.; Hanna, M. G.; Bugiardini, E.; Hostettler, I.; O'Callaghan, B.; Khan, A.; Cortese, A.; O'Connor, E.; Yau, W. Y.; Bourinaris, T.; Kaiyrzhanov, R.; Chelban, V.; Madej, M.; Diana, M. C.; Vari, M. S.; Pedemonte, M.; Bruno, C.; Balagura, G.; Scala, M.; Fiorillo, C.; Nobili, L.; Malintan, N. T.; Zanetti, M. N.; Krishnakumar, S. S.; Lignani, G.; Jepson, J. E. C.; Broda, P.; Baldassari, S.; Rossi, P.; Fruscione, F.; Madia, F.; Traverso, M.; De-Marco, P.; Perez-Duenas, B.; Munell, F.; Kriouile, Y.; El-Khorassani, M.; Karashova, B.; Avdjieva, D.; Kathom, H.; Tincheva, R.; Van-Maldergem, L.; Nachbauer, W.; Boesch, S.; Gagliano, A.; Amadori, E.; Goraya, J. S.; Sultan, T.; Kirmani, S.; Ibrahim, S.; Jan, F.; Mine, J.; Banu, S.; Veggiotti, P.; Zuccotti, G. V.; Ferrari, M. D.; Van Den Maagdenberg, A. M. J.; Verrotti, A.; Marseglia, G. L.; Savasta, S.; Soler, M. A.; Scuderi, C.; Borgione, E.; Chimenz, R.; Gitto, E.; Dipasquale, V.; Sallemi, A.; Fusco, M.; Cuppari, C.; Cutrupi, M. C.; Ruggieri, M.; Cama, A.; Capra, V.; Mencacci, N. E.; Boles, R.; Gupta, N.; Kabra, M.; Papacostas, S.; Zamba-Papanicolaou, E.; Dardiotis, E.; Maqbool, S.; Rana, N.; Atawneh, O.; Lim, S. Y.; Shaikh, F.; Koutsis, G.; Breza, M.; Coviello, D. A.; Dauvilliers, Y. A.; Alkhawaja, I.; Alkhawaja, M.; Al-Mutairi, F.; Stojkovic, T.; Ferrucci, V.; Zollo, M.; Alkuraya, F. S.; Kinali, M.; Sherifa, H.; Benrhouma, H.; Turki, I. B. Y.; Tazir, M.; Obeid, M.; Bakhtadze, S.; Saadi, N. W.; Zaki, M. S.; Triki, C. C.; Benfenati, F.; Gustincich, S.; Kara, M.; Belcastro, V.; Specchio, N.; Capovilla, G.; Karimiani, E. G.; Salih, A. M.; Okubadejo, N. U.; Ojo, O. O.; Oshinaike, O. O.; Oguntunde, O.; Wahab, K.; Bello, A. H.; Abubakar, S.; Obiabo, Y.; Nwazor, E.; Ekenze, O.; Williams, U.; Iyagba, A.; Taiwo, L.; Komolafe, M.; Senkevich, K.; Shashkin, C.; Zharkynbekova, N.; Koneyev, K.; Manizha, G.; Isrofilov, M.; Guliyeva, U.; Salayev, K.; Khachatryan, S.; Rossi, S.; Silvestri, G.; Haridy, N.; Ramenghi, L. A.; Xiromerisiou, G.; David, E.; Aguennouz, M.; Fidani, L.; Spanaki, C.; Tucci, A.; Raspall-Chaure, M.; Chez, M.; Tsai, A.; Fassi, E.; Shinawi, M.; Constantino, J. N.; De Zorzi, R.; Fortuna, S.; Kok, F.; Keren, B.; Bonneau, D.; Choi, M.; Benzeev, B.; Zara, F.; Mefford, H. C.; Scheffer, I. E.; Clayton-Smith, J.; Macaya, A.; Rothman, J. E.; Eichler, E. E.; Kullmann, D. M.; Houlden, H.
Analysis of state-specific vibrations coupled to the unidirectional energy transfer in conjugated dendrimers 1-gen-2012 Soler, M. A.; Roitberg, A. E.; Nelson, T.; Tretiak, S.; Fernandez-Alberti, S.
Antibody Affinity Maturation Using Computational Methods: From an Initial Hit to Small-Scale Expression of Optimized Binders 1-gen-2023 Medagli, Barbara; Soler, Miguel A; De Zorzi, Rita; Fortuna, Sara
Antibody-Antigen Binding Interface Analysis in the Big Data Era 1-gen-2022 Reis, P. B. P. S.; Barletta, G. P.; Gagliardi, L.; Fortuna, S.; Soler, M. A.; Rocchia, W.
Assessing the capability of in silico mutation protocols for predicting the finite temperature conformation of amino acids 1-gen-2018 Ochoa, R.; Soler, M. A.; Laio, A.; Cossio, P.
Binding affinity prediction of nanobody-protein complexes by scoring of molecular dynamics trajectories 1-gen-2018 Soler, M. A.; Fortuna, S.; De Marco, A.; Laio, A.
Computational design of cyclic peptides for the customized oriented immobilization of globular proteins 1-gen-2017 SOLER BASTIDA, Miguel Angel; Rodriguez, Alex; Russo, Anna; Adedeji, Abimbola Feyisara; Dongmo Foumthuim, Cedrix J.; Cantarutti, Cristina; Ambrosetti, Elena; Casalis, Loredana; Corazza, Alessandra; Scoles, Giacinto; Marasco, Daniela; Laio, Alessandro; Fortuna, Sara
Computational evolution of beta-2-microglubulin binding peptides for nanopatterned surface sensors 1-gen-2021 Adedeji Olulana, A. F.; Soler, M. A.; Lotteri, M.; Vondracek, H.; Casalis, L.; Marasco, D.; Castronovo, M.; Fortuna, S.
Computational Evolution Protocol for Peptide Design 1-gen-2022 Ochoa, R.; Soler, M. A.; Gladich, I.; Battisti, A.; Minovski, N.; Rodriguez, A.; Fortuna, S.; Cossio, P.; Laio, A.
Computational Mutagenesis of Antibody Fragments: Disentangling Side Chains from ΔΔG Predictions 1-gen-2024 Tandiana, R.; Barletta, G. P.; Soler, M. A.; Fortuna, S.; Rocchia, W.
Conformational Changes of Trialanine in Water Induced by Vibrational Relaxation of the Amide i Mode 1-gen-2016 Bastida, A.; Zuniga, J.; Requena, A.; Miguel, B.; Candela, M. E.; Soler, M. A.
Description of conformational ensembles of disordered proteins by residue-local probabilities 1-gen-2023 Bastida, A.; Zúñiga, J.; Miguel, B.; Soler, M. A.
Distance-Based Configurational Entropy of Proteins from Molecular Dynamics Simulations 1-gen-2015 Fogolari, Federico; Corazza, Alessandra; Fortuna, Sara; Soler, Miguel Angel; Vanschouwen, Bryan; Brancolini, Giorgia; Corni, Stefano; Melacini, Giuseppe; Esposito, Gennaro
Effect of humanizing mutations on the stability of the llama single-domain variable region 1-gen-2021 Soler, M. A.; Medagli, B.; Wang, J.; Oloketuyi, S.; Bajc, G.; Huang, H.; Fortuna, S.; De Marco, A.
Effects of knot type in the folding of topologically complex lattice proteins 1-gen-2014 Soler, M. A.; Nunes, A.; Faisca, P. F. N.